Simptomele de malabsorbție a vitaminei B12 se dezvoltă încă din primele luni ale vieții copilului. Acestea observă slăbiciune, paloare, întârziere în dezvoltarea fizică, diaree. După 6-30 luni de la debutul primelor simptome, se observă tulburări neurologice: retard mental, neuropatie, mielopatie.