Trunchiul creierului este extensia măduvei spinării în direcția rostrală. Limita condiționată dintre ele este locul unde ies la iveală primele rădăcini de col uterin și crucea piramidelor. Trunchiul este împărțit în creierul posterior și cel mijlociu. Primul include medulla oblongata, podul cerebral și cerebelul. Este o continuare a mezencefal, care este format din creier si quadrigemina picioare si situata la marginea diencefalului (talamus, hipotalamus, subtalamus).