Genomului HCV conține ARN monocatenar încărcat pozitiv, care codifică 3 structural (proteina core nucleocapsidei și nucleoproteine plic E1-E2) și 5 proteine structurale (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5). Fiecare dintre aceste proteine sunt anticorpi sintetizați găsit în sângele pacienților cu hepatită C.